순차 파일과 인덱스 순차 파일의 차이는 데이터 접근 방식에 있다. 순차 파일은 데이터를 순차적으로 읽어야 하는 반면, 인덱스 순차 파일은 인덱스를 사용해 더 빠르게 원하는 데이터에 접근할 수 있다. 따라서 인덱스 순차 파일은 검색 효율성이 높아 특정 검색 시 성능이 개선된다.