암모니아 누설시험의 단점은 검사 부위에 부식이 일어날 수 있다는 점이다. 이는 시험이 강한 화학 물질을 사용하기 때문에 부식이 발생할 가능성이 높아지고, 이를 해결하기 위한 후처리가 필요하다. 따라서 부식으로 인한 추가 비용과 안전 문제가 발생할 수 있다.