문제에서 물류시설의 개발 및 운영과 관련한 법령상 물류시설개발종합계획의 내용 중 포함되지 않는 사항을 묻고 있습니다. 선택지 중 '국토교통부 장관'이 필요한 절차와 행정 처분을 주관하는 사항은 물류시설 개발과 직접적인 관련이 없으며, 이는 물류시설의 구체적인 운영이나 시설 설계보다는 정책적인 부분에 해당합니다. 따라서 정답은 4번입니다.