미생물 배양 시 온도는 생육과 대사 활성을 결정짓는 중요한 요소이다. 적정 온도를 유지해야 미생물이 최적의 성장과 생산성을 발휘할 수 있다. 따라서 배양 온도가 가장 중요한 고려사항이 된다.