관통형 코일을 사용했을 때의 단점은 원주 방향의 불연속부의 위치구별이 어렵다는 점이다. 이는 결함 탐지 및 정확한 위치 확인에 영향을 미친다. 따라서 원주 방향의 단점이 중요한 고려사항이 된다.