의료폐기물 전용 용기의 재질은 법적으로 정해져 있으며, 일반적으로 내구성과 안정성이 요구된다. 따라서 재활용이 가능한 재질이 아닌 경우가 많고, 주의 깊은 관리가 필요하다. 이는 환경 보호와 공공 안전을 위해 필수적이다.