생물학적 오염(biological pollution)은 주로 외래 생물이나 병원균이 자연 생태계에 유입되어 생태적 균형을 해치는 현상을 의미한다. 이러한 현상은 생물체 간의 상호작용을 변화시켜 생태계의 건강성과 안정성을 저해할 수 있다. 따라서, 생물학적 오염은 생태계의 기능에 심각한 영향을 미치는 중요한 문제이다.