cis-trans 이성질체는 원자의 배치에 따라 물질의 성질이 달라진다. 주로 이중 결합을 가지는 탄소 원자 사이에서 발생하며, 동일한 원자가 다른 위치에 있을 때 cis 형태, 반대편에 있을 때 trans 형태로 구분된다. 따라서, 이성질체 간의 차이는 물리적 및 화학적 성질에 큰 영향을 미친다.