HKEY_CLASSES_ROOT는 파일 형식과 관련된 정보만을 저장하며, 로컬 컴퓨터의 설정이나 사용자 설정을 다루지 않는다. 따라서 HKEY_LOCAL_MACHINE 및 HKEY_CURRENT_USER와는 다른 목적을 가지고 있다. 이로 인해 HKEY_CLASSES_ROOT는 설명에서 제외된다.