생태계 분류는 생물체의 상호작용과 서식지를 포함하여 다양한 요소를 분석하는 과정이다. 이에 따라 생태계는 일반적으로 계층적으로 이루어져 있으며, 다양한 생물의 관계가 반영된다. 따라서 생태계의 적절한 설명은 생물 간의 관계 및 환경적 요소를 종합적으로 고려해야 한다.