한국토지정보시스템 운영기관은 장기 데이터 백업 주기를 월 1회로 설정해야 합니다. 이는 데이터의 안정성을 높이고, 데이터 손실로 인한 문제를 최소화하기 위해 정기적인 백업이 필요하기 때문입니다. 따라서 정답은 '3. 월 1회'입니다.